Skip to main content

Table 1 FA-PNEU results and antibiotic management (this table should appear after the result section)

From: Co-infections in COVID-19 critically ill and antibiotic management: a prospective cohort analysis

Patient no.

Sample type

FA-PNEU results

Treatment switch initiated by FA-PNEU results

Detected pathogens (106 ≥ 107)

Initial antibiotherapy

Subsequent antibiotherapy

1

Sputum

None

None

2

ETA

Pseudomonas aeruginosa

None

Ceftazidime

3

ETA

Moraxella catarrhalis

None

Cefuroxime

4

ETA

None

None

5

ETA

None

None

6

Sputum

None

None

7

ETA

None

None

8

ETA

Cefuroxime

None

9

Sputum

Haemophilus influenza

None

Cefuroxime

10

ETA

None

None

11

ETA

Cefuroxime

None

12

ETA

M. catarrhalis

Cefuroxime

Cefuroxime

13

ETA

Staphylococcus aureus

None

Flucloxacilline

14

ETA

None

None

15

ETA

None

None

16

ETA

Streptococcus agalactiae

Cefuroxime

Cefuroxime

17

Sputum

None

None

18

ETA

S. aureus

None

Flucloxacilline

19

ETA

Cefuroxime

None

20

ETA

None

None

21

ETA

S. aureus

Amoxicilline - clavulanic acid

Amoxicilline - clavulanic acid

22

Sputum

H. influenza

None

Cefuroxime

23

ETA

H. influenza

None

Cefuroxime

24

ETA

Cefuroxime

None

25

ETA

S. aureus

Cefuroxime

Flucloxacilline

26

ETA

None

None

27

Sputum

S. aureus + mecA/C

None

Vancomycine

28

Sputum

None

None

29

Sputum

None

None

30

Sputum

Piperacilline-tazobactam

None

31

ETA

None

None

32

ETA

S. aureus + mecA/C − H. influenza

None

Vancomycine + cefuroxime

  1. ETA endotracheal aspirate, FA-PNEU FilmArray Pneumonia Panel plus test